学习笔记Day12：初探LInux 2

Linux初探

同一个目录中不允许出现文件及文件夹重名

查看文件

cat （Concatenate）查看文本文件内容，输出到屏幕（标准输出流）
- 常用参数
  - -A打印所有字符，包括特殊字符（换行符、制表符等）
  - -n/-b标记行号，-n标记空行，-b不标记空行
- 常见用法
  
  cat > file创建一个新文件file，并可以将简单内容写入文件。
  
  >为重定向符，意为把cat原本输出到屏幕的内容写入file的文件，会覆盖。
  
  >>追加符，可以继续写入文件，不覆盖。
  
  zcat可以读压缩文件
tac倒着看文件（从倒数第一行开始输出）
head 查看文件的前n行（默认10行）

tail查看文件的后n行（默认10行）
- 常用参数
  - -n设置看多少行的参数
- 常见用法
  
  cat file.txt | head -n3 等价 head -n3 file.txt
  
  |管道符号
more逐页查看文件，按空格翻页，按回车换行，q退出

less more的升级版，常用的查看文件命令
- 常见参数
  - -N 显示行号
  - -S 单行显示（可以上下左右翻阅）
- 常见用法
  
  /keyword进行关键词搜索；n/N上下跳转关键词。
wc（word count）统计文本
- 常见参数
  - -l 统计行数（比较常用）
  - -w 统计字符串数，连在一起的字母是一个字符串。
  - -c 统计字节数，包括特殊字符，如换行符和制表符等。
- 常见用法
  
  wc -l file1.txt file2.txt file3.txt 输出三个文件行数及总计行数
cut 文本分割
- 常见参数：
  - -d 指定分隔符，默认\t；
  - -f输出哪几列（字段fields）
- 常见用法：
  
  less -SN Data/example.gtf | cut -f 1,3-5 | less 以默认制表符分割成列，取出1，3，4，5列（不会乱序）
sort 排序
- 常见参数：
  - -n 按照数值从小到大排序（默认是按照字符串理解数字的）
  - -V 字符串中含数值时，按照数值从小到大排序
  - -r 逆向排序
  - -k 按照哪一列进行排序
  - -t 指定分隔符
- 常见用法
  
  less exp.csv | sort -k 3 -n| less -SN 根据第3列按照数值排序
uniq 去除重复行，只能去除上下挨着的重复行，需要结合sort使用
- 常见参数
  - -C 统计每个字符串连续出现的行数
- 常见用法
  
  cat file.gtf | cut -f3 | sort | uniq -c 将文件以制表符分割的第三列排序后统计出现了多少次（联想R的table）
paste 文本合并
- 常见参数
  - -d 指定分隔符
  - -s 按行合并
- 常见用法
  - paste file1 file2 默认按列合并
  - seq 20 | paste - - 很有意思！试一下！
tr 字符替换
- 常见参数
  - -d 删除
  - -s 缩减连续重复字符
- 常见用法
  
  tr 'a' 'A' 把小写a换成大写A，全部替换
  
  tr ' ' '\t'把空格替换成制表符
  
  tr '\n' ' '把换行符替换成空格