目前已定位到是因为C#中的byte范围是0到255，而java中byte值为-128到127导致的错误。

尝试过使用C#的sbyte来解决：

bw1 = new BinaryWriter(new FileStream("C:\\Users\\DELL\\Desktop\\SpatialIndex\\ctest1.bin", FileMode.Create));

bw2 = new BinaryWriter(new FileStream("C:\\Users\\DELL\\Desktop\\SpatialIndex\\ctest2.bin", FileMode.Create));

byte[] bits=BitConverter.GetBytes(501751.060001268);//测试数据

sbyte[] bitsb = new sbyte[8];

for (int i = 0; i < bits.Length; i++)

{

byte abyte = bits[i];

if (abyte > 127)

{

bitsb[i] = (sbyte)(abyte - 256);

}

else

{

bitsb[i] = (sbyte)abyte;

}

bw1.Write(bitsb[i]);

bw2.Write(bits[i]);

}

但是写入后对比，两个文件中的内容还是一样，并没有生成为java二进制格式。

不知道有哪位高人也遇到并解决过类似问题。