8.1 医疗影像AI:UNet与TransUNet模型实战
在医疗人工智能领域,医学影像分析是一个核心应用方向。从X光片、CT扫描到MRI图像,医疗影像数据蕴含着丰富的诊断信息。然而,如何有效地从这些复杂的图像中提取出有价值的医学信息,一直是研究的热点问题。本章将深入探讨医疗影像分析中的经典模型UNet以及其改进版本TransUNet,并通过实战代码展示如何构建和训练这些模型来解决医学图像分割任务。
医疗影像分析概述
医疗影像分析是计算机视觉在医疗领域的重要应用,主要任务包括:
其中,图像分割是医疗影像分析中最重要和最具挑战性的任务之一。与普通图像不同,医疗影像通常具有以下特点:
- 高分辨率:医疗影像通常具有很高的分辨率,包含大量细节信息
- 复杂结构:人体器官和组织结构复杂,边界模糊
- 低对比度:某些组织之间的对比度较低,难以区分
- 噪声干扰:成像过程中可能引入各种噪声
- 个体差异:不同患者之间的解剖结构存在差异
UNet模型详解
UNet是由Olaf Ronneberger等人在2015年提出的用于生物医学图像分割的经典网络架构。它采用了编码器-解码器的对称结构,并引入了跳跃连接机制,有效解决了梯度消失问题。
UNet网络结构
importtorchimporttorch.nnasnnimporttorch.nn.functionalasFclassUNetEncoderBlock(nn.Module):"""UNet编码器块"""def__init__(self,in_channels,out_channels):super(UNetEncoderBlock,self).__init__()self.conv1=nn.Conv2d(in_channels,out_channels,kernel_size=3,padding=1)self.conv2=nn.Conv2d(out_channels,out_channels,kernel_size=3,padding=1)self.bn1=nn.BatchNorm2d(out_channels)self.bn2=nn.BatchNorm2d(out_channels)self.relu=nn.ReLU(inplace=True)self.pool=nn.MaxPool2d(2)defforward(self,x):x=self.relu(self.bn1(self.conv1(x)))x=self.relu(self.bn2(self.conv2(x)))pooled=self.pool(x)returnx,pooledclassUNetDecoderBlock(nn.Module):"""UNet解码器块"""def__init__(self,in_channels,out_channels):super(UNetDecoderBlock,self).__init__()self.upconv=nn.ConvTranspose2d(in_channels,out_channels,kernel_size=2,stride=2)self.conv1=nn.Conv2d(in_channels,out_channels,kernel_size=3,padding=1)self.conv2=nn.Conv2d(out_channels,out_channels,kernel_size=3,padding=1)self.bn1=nn.BatchNorm2d(out_channels)self.bn2=nn.BatchNorm2d(out_channels)self.relu=nn.ReLU(inplace=True)defforward(self,x,skip_connection):x=self.upconv(x)# 跳跃连接拼接x=torch.cat([x,skip_connection],dim=1)x=self.relu(self.bn1(self.conv1(x)))x=self.relu(self.bn2