钱学森将马克思主义哲学与现代科学技术体系深度融合，构建了独具特色的科学学思想体系。以下是其理论的核心内容及学术贡献：

一、马克思主义哲学的科学指导地位

1. 哲学的最高统领性

钱学森认为，马克思主义哲学（辩证唯物主义）是对客观世界认识的最高概括，是全部科学技术的理论基石。他强调科学研究必须坚持马克思主义哲学指导，主张用具体科学成果不断丰富其内涵。

2. 科学研究的辩证方法论

在技术科学研究中，他提出"灵活结合理论与实际"的方法论，指出这是辩证唯物主义的精髓之一，强调理论需服务于实践，实践反哺理论创新。

二、现代科学技术体系的系统建构

1. 三层级梳状结构模型

最高层：马克思主义哲学（辩证唯物主义）；

中间层：11架"桥梁"学科（如自然辩证法、历史唯物主义等），连接哲学与具体科学；

基础层：11大科学技术部门（包括自然科学、社会科学、系统科学等）。该体系首次明确将系统科学、思维科学等列为独立部类。

2. 科学的系统分类与融合

主张打破学科壁垒，通过系统科学方法论整合多领域知识。例如：

系统科学：作为贯穿各领域的核心理论，解决复杂巨系统问题（如航天工程、社会经济）；

综合集成法：提出"从定性到定量"的综合研究方法，为复杂问题提供实践路径。

三、科学学的学科建构与分支

钱学森将科学学定位为社会科学的技术科学层次，并划分三大分支：

1. 科学技术体系学：研究学科结构与发展规律；

2. 科学能力学：分析科研生产力与创新机制；

3. 政治科学学：探索科技政策与国家战略的互动关系。

四、思想渊源与实践印证

1. 学术根基的形成留美期间师从冯·卡门，习得"从工程提炼理论，用理论指导实践"的研究方法，奠定其技术科学思想基础。

2. 马克思主义的深化认知归国后系统学习马克思主义哲学，坦言其方法论远胜自己前期经验，由此确立"科技研究必须依靠马克思主义哲学"的信念。

3.系统工程的成功实践在中国航天事业中应用系统思想，验证了马克思主义指导下复杂工程管理的可行性。

五、学术价值与当代启示

钱学森的理论突破了传统科学分类框架，其贡献在于：

1.开创性：首次构建以马克思主义哲学为统领的完整科学技术体系；

2.前瞻性：早于国际学界提出复杂性科学研究方法论（如综合集成法）；

3.实践性：推动系统工程在国家重大科技项目中的落地，如"两弹一星"工程。

他的思想启示当代科技发展需坚持哲学指导与学科交叉并重，尤其对人工智能、数字经济等新兴领域的治理具有重要参考价值。